(一)贯彻执行国家和自治区关于卫生工作的法律、法规和方针政策，并监督实施。
   (二)研究提出并组织实施全旗界生事业发展规划，年度计划；组织实施国家、自治区；卫生技术规范和标准；制定我旗有关卫生技术规范和标准，并组织实施；研究提出我旗区域卫生规划、统筹规划与协调全旗卫生资源配置，并组织指导卫生规划、计划的实施。
   (三)研究制订全旗农村牧区卫生工作规划和政策措施，指导实施初级卫生保健规划。群众健康危害及重大疾病的防治规划；组织对重大疾病的综合防治。 
   (四)根据《母婴保健法》，做好本区域内母婴保健监测及技术指导和医疗保健管理工作，做好广大妇女儿童的预防保健工作。
   (五)依据国家有关卫生监督法规，对传染病防治、食品卫生、化妆品、职业、环境、放射、学校卫生等实施监督监测，指导卫生防疫、监督监测机构的认证管理工作。 
   (六)研究制订全旗卫生人才发展规划，组织管理旗内重点医疗卫生科研攻关，指导医学科技的普及应用工作。执行卫生技术人员资格考试认定标准，并组织实施。
   (七)贯彻中(蒙)西医并重的方针，推进中(蒙)医的继承与发扬。指导全旗中 (蒙)医医疗机构业务建设、人才培养及科研发展工作。
   (八)组织调度全旗卫生技术力量，协助旗人民政府和有关部门，对重大意外事件、重大突发疫情、疾病组织紧急救护，防止和控制疫情、疾病的发生、蔓延。
   (九)研究指导全旗医疗机构改革，贯彻有关执业标准、医疗质量标准和服务规范，并监合实施。